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  • Textbook
  • © 2004

Bioinformatik

Ein Leitfaden für Naturwissenschaftler

Birkhäuser

Authors:

  • Stark praxisorientiert
  • Gut verständlich geschrieben
  • Aktualisierte und ergänzte Neuauflage

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Table of contents (10 chapters)

  1. Front Matter

    Pages i-6
  2. Einstieg in die Sequenzanalyse

    • Andrea Hansen
    Pages 7-8
  3. Primäre Datenbanken

    • Andrea Hansen
    Pages 9-19
  4. Sequenzformate

    • Andrea Hansen
    Pages 21-24
  5. Einfache Alignments

    • Andrea Hansen
    Pages 25-48
  6. Heuristische Methoden zum Sequenzvergleich

    • Andrea Hansen
    Pages 49-65
  7. Multiple Alignments

    • Andrea Hansen
    Pages 67-79
  8. Phylogenetische Analysen

    • Andrea Hansen
    Pages 81-102
  9. Abgeleitete Datenbanken

    • Andrea Hansen
    Pages 103-111
  10. Primerdesign

    • Andrea Hansen
    Pages 113-116
  11. Genomanalyse

    • Andrea Hansen
    Pages 117-128
  12. Back Matter

    Pages 129-158

About this book

Locker und leicht verständlich geschrieben führt dieser Leitfaden in die Grundlagen und Möglichkeiten der Sequenzanalyse ein.

Das Buch beginnt mit einer Einführung in die wichtigen Sequenzdatendatenbanken am NCBI und EMBL sowie in die wachsende Zahl der Motivdatenbanken. Anschließend werden die einfachsten Methoden des paarweisen Sequenzvergleiches in globalen und lokalen Alignments beschrieben sowie die gängigsten heuristischen Verfahren der Datenbanksuche (FASTA und BLAST). Multiple Alignments, Substitutionsmatrizen und die Berechnung phylogenetischer Bäume werden dem Leser nahe gebracht. Neu hinzugekommen sind auch Erläuterungen der Prinzipien der Genomanalyse und der gängigsten Algorithmen zur Genvorhersage. Zu jeder Methode werden Online-Tools im Internet oder freie Software angegeben.

Das Buch richtet sich an Anwender und Einsteiger in die Bioinformatik, speziell Studenten und Forscher, die sich mit der Sequenzanalyse auseinandersetzen müssen.

Reviews

Das Buch deckt alle Aspekte der Sequenzbearbeitung und –verarbeitung ab und macht es so zu einem Standardwerk der Bioinformatik. (BIOspektrum)

Authors and Affiliations

  • Gräfelfing, Deutschland

    Andrea Hansen

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