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Multiple Sequenzalignments

Welches Programm passt zu meinen Daten?

Autoren: Sperlea, Theodor

Vorschau
  • bietet praktische Hilfestellung bei der Entscheidungsfindung für Multiple Sequenzalignment Programme 
  • auch ohne bioinformatische Kenntnisse zu verstehen
  • listet die gängigen Formate und Einsatzfelder von MSA-Programmen
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  • ISBN 978-3-662-58811-6
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  • ISBN 978-3-662-58810-9
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Über dieses Lehrbuch

Dieses Buch ist ein praktischer Ratgeber für Biologinnen und Biologen, die Multiple Sequenzalignments (MSAs) für ihre Datenanalysen verwenden und einen verständlichen Überblick über die vielen verschiedenen Programme suchen. Trotz ihres wichtigen Stellenwertes in der Datenanalyse herrscht Unsicherheit unter den Forschenden wie MSA-Programme genau funktionieren - ganz zu schweigen davon, wie und warum die unterschiedlichen Analysen zu verschiedenen Ergebnissen führen. Welches Programm ist für die Auswertung meiner Daten das richtige und wie kann ich sicherstellen, alle relevanten Erkenntnisse aus den Alignments gezogen zu haben? Dieses Buch bietet hilfreiche Erklärungen und Hintergründe ohne große bioinformatische Vorkenntnisse vorauszusetzen und führt die Leserinnen und Leser langsam in die Thematik ein.Im ersten Teil des Buches werden die möglichen Einsatzfelder wie auch die Formate, die üblicherweise von MSA-Programmen produziert werden, im Detail beschrieben. Ebenso werden auf unkomplizierte Weise die zentralen Algorithmen sowie die inneren Abläufe der gängigsten MSA-Programme der Vergangenheit und der Gegenwart in größerer Detailtiefe erklärt. Den zweiten Teil des Buches bildet ein ausführlicher datenbasierter Vergleich zwischen MSA-Programmen, der als Entscheidungshilfe für die Programmauswahl für dein nächstes Alignment dienen soll. 

Über den Autor

Theodor Sperlea studierte in Marburg Biologie und Molecular and Cellular Biology mit einem Schwerpunkt in Mikrobiologie und Genetik. Früh im Studium hatte er erste Kontaktmöglichkeiten mit MSAs als Werkzeug zur Untersuchung von evolutionären Verhältnissen zwischen Genen verschiedener Organismen. Durch seine Promotion, in der er die Ökologie von Mikroorganismen in Seen mit statistischen und bioinformatischen Methoden untersucht hat, konnte er sich einen tieferen Einblick in die informatische Seite und somit die Funktionsweise von MSA-Programmen erarbeiten.

Video

Inhaltsverzeichnis (5 Kapitel)

Inhaltsverzeichnis (5 Kapitel)
  • Multiple Sequenzalignments: eine Einführung

    Seiten 3-16

    Sperlea, Theodor

  • Wie funktionieren MSA-Programme?

    Seiten 17-36

    Sperlea, Theodor

  • Übersicht aktueller MSA-Programme

    Seiten 37-54

    Sperlea, Theodor

  • Details zur Analyse der Programme

    Seiten 57-72

    Sperlea, Theodor

  • Entscheidungshilfe

    Seiten 73-88

    Sperlea, Theodor

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Bibliografische Information

Bibliographic Information
Buchtitel
Multiple Sequenzalignments
Buchuntertitel
Welches Programm passt zu meinen Daten?
Autoren
Copyright
2019
Verlag
Springer Spektrum
Copyright Inhaber
Springer-Verlag GmbH Deutschland, ein Teil von Springer Nature
eBook ISBN
978-3-662-58811-6
DOI
10.1007/978-3-662-58811-6
Softcover ISBN
978-3-662-58810-9
Auflage
1
Seitenzahl
XII, 102
Anzahl der Bilder
13 schwarz-weiß Abbildungen, 11 Abbildungen in Farbe
Themen