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Methods in Molecular Biology

Next Generation Sequencing

Methods and Protocols

Herausgeber: Head, Steven R., Ordoukhanian, Phillip, Salomon, Daniel R. (Eds.)

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  • Includes cutting-edge methods and protocols 
  • Provides step-by-step detail essential for reproducible results
  • Contains key notes and implementation advice from the experts
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Über dieses Buch

This volume covers a wide range of various fields of research, with the common thread being Next Generation Sequencing (NGS) related methods and applications, as well as analysis and interpretation of the data obtained. Chapters guide readers through the highly dynamic processes of translational and transcriptional profiling of a cell, method to detect copy number alterations (CNAs), targeted sequencing applications,  method called “Hi-Plex” to characterize known polymorphic loci, single-cell of DNA or RNA, identify and characterize rare circulating CD4 T cells, and computational pipeline for RNAseq analysis. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Authoritative and practical, Next Generation Sequencing: Methods and Protocols aims to be useful and informative for further study into this vital field. 

Inhaltsverzeichnis (16 Kapitel)

Inhaltsverzeichnis (16 Kapitel)
  • An Integrated Polysome Profiling and Ribosome Profiling Method to Investigate In Vivo Translatome

    Seiten 1-18

    Jin, Hyun Yong (et al.)

  • Measuring Nascent Transcripts by Nascent-seq

    Seiten 19-26

    Chen, Fei Xavier (et al.)

  • Genome-Wide Copy Number Alteration Detection in Preimplantation Genetic Diagnosis

    Seiten 27-42

    Deleye, Lieselot (et al.)

  • Multiplexed Targeted Sequencing for Oxford Nanopore MinION: A Detailed Library Preparation Procedure

    Seiten 43-51

    Karamitros, Timokratis, Ph.D. (et al.)

  • Hi-Plex for Simple, Accurate, and Cost-Effective Amplicon-based Targeted DNA Sequencing

    Seiten 53-70

    Pope, Bernard J. (et al.)

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Bibliografische Information

Bibliographic Information
Buchtitel
Next Generation Sequencing
Buchuntertitel
Methods and Protocols
Herausgeber
  • Steven R. Head
  • Phillip Ordoukhanian
  • Daniel R. Salomon
Titel der Buchreihe
Methods in Molecular Biology
Buchreihen Band
1712
Copyright
2018
Verlag
Humana Press
Copyright Inhaber
Springer Science+Business Media, LLC
eBook ISBN
978-1-4939-7514-3
DOI
10.1007/978-1-4939-7514-3
Hardcover ISBN
978-1-4939-7512-9
Softcover ISBN
978-1-4939-8507-4
Buchreihen ISSN
1064-3745
Auflage
1
Seitenzahl
XIII, 266
Anzahl der Bilder
10 schwarz-weiß Abbildungen, 41 Abbildungen in Farbe
Themen