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Birkhäuser

Bioinformatik

Methoden zur Vorhersage von RNA- und Proteinstrukturen

  • Textbook
  • © 2003

Overview

Authors:
  1. Gerhard Steger

    1. Institut für Physikalische Biologie, Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Germany

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  • Übersicht über aktuelle Bioinformatik-Methoden anhand konkreter biologischer Themen
  • Der Autor leitet eine Biocomputing-Arbeitsgruppe an der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf
  • Grundlage des Buches ist der Stoff der Bioinformatik II Vorlesung des Autors
  • Ausführliches Literaturverzeichnis
  • Index zu besprochenen Programmen

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Table of contents (16 chapters)

  1. Front Matter

    Pages i-x
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  2. Strukturvorhersage von Nukleinsäuren

    1. Front Matter

      Pages 1-1
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    2. Struktur und Funktion von RNA

      • Gerhard Steger
      Pages 3-37

    3. Kooperative Gleichgewichte in doppelsträngigen Nukleinsäuren

      • Gerhard Steger
      Pages 39-55

    4. Graphen und Alignments

      • Gerhard Steger
      Pages 57-71

    5. RNA-Sekundärstruktur-Vorhersage per Graphentheorie

      • Gerhard Steger
      Pages 73-94

    6. RNA-Sekundärstruktur-Vorhersage per Informationstheorie

      • Gerhard Steger
      Pages 95-113

    7. RNA-Sekundärstruktur-Vorhersage mit Genetischen Algorithmen

      • Gerhard Steger
      Pages 115-126

    8. RNA-Sekundärstrukturfaltung

      • Gerhard Steger
      Pages 127-146

  3. Strukturvorhersage von Proteinen

    1. Front Matter

      Pages 147-147
      Download chapter PDF

    2. Protein-Struktur

      • Gerhard Steger
      Pages 149-174

    3. Energetik von Protein-Strukturen

      • Gerhard Steger
      Pages 175-183

    4. Protein-Sekundärstruktur-Vorhersage

      • Gerhard Steger
      Pages 185-198

    5. Qualität von Vorhersagen

      • Gerhard Steger
      Pages 199-205

    6. Vorhersage von Transmembran-Helices per Hidden-Markov-Modell

      • Gerhard Steger
      Pages 207-218

    7. Protein-Sekundärstruktur-Vorhersage per Neuronalem Netz

      • Gerhard Steger
      Pages 219-245

    8. Proteinfaltung mit ab-initio-Methoden

      • Gerhard Steger
      Pages 247-252

    9. Inverse Proteinfaltung — „Threading“

      • Gerhard Steger
      Pages 253-268

    10. Proteinfaltung per Homologie-Modellierung

      • Gerhard Steger
      Pages 269-278

  4. Back Matter

    Pages 279-302
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Keywords

About this book

Mit Hilfe der Bioinformatik können ermittelte DNA-, RNA- oder Aminosäuresequenzen hinsichtlich Struktur und Funktion schnell eingeschätzt werden; das spart Kosten und Zeit bei weiterführenden Experimenten im Labor. Das vorliegende Buch gliedert sich in einen RNA- und einen Protein-Teil. Je ein Kapitel führt das biologische Thema der Strukturvorhersage inklusive biophysikalischer Grundlagen der Vorhersagemethoden ein. Folgekapitel gehen auf die informationstechnischen Methoden mit einem möglichst kurzen Beispiel ein, stellen den meist komplizierteren Algorithmus zur Lösung des biologischen Problems vor und diskutieren zum Abschluss mindestens eine Implementation und damit erzielbare Ergebnisse anhand eines biologischen Beispiels. Das Buch ist gleichermassen für Biologen und Informatiker relevant, da es sowohl einen Überblick über die aktuellen Möglichkeiten der Strukturvorhersage gibt als auch den Einsatz von unterschiedlichsten informationstechnischen Methoden in der Biologie demonstriert.

Authors and Affiliations

  • Institut für Physikalische Biologie, Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Germany

    Gerhard Steger

Bibliographic Information

  • Book Title: Bioinformatik

  • Book Subtitle: Methoden zur Vorhersage von RNA- und Proteinstrukturen

  • Authors: Gerhard Steger

  • DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-0348-7984-2

  • Publisher: Birkhäuser Basel

  • eBook Packages: Springer Book Archive

  • Copyright Information: Springer Basel AG 2003

  • Softcover ISBN: 978-3-7643-6951-4Published: 01 April 2003

  • eBook ISBN: 978-3-0348-7984-2Published: 07 March 2013

  • Edition Number: 1

  • Number of Pages: X, 302

  • Number of Illustrations: 116 b/w illustrations

  • Topics: Pharmacology/Toxicology, Biotechnology, Biochemistry, general, Bioinformatics, Proteomics, Cell Biology

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